Klinisk Akademiker

Afdeling for Molekylær Diagnostik (AfMD) søger en klinisk akademiker på fuldtid til arbejde med long-read sekventering.

Indledning
Er du ambitiøs, ønsker et job med ansvar, indflydelse og en lang række udviklingsopgaver? Har du erfaring med hele processen fra datagenerering, analysering og fortolkning af long-read sekventeringsdata. Så har vi jobbet.

Om jobbet
Vi søger en motiveret Klinisk Akademiker til at styrke vores afdeling i forbindelse med en aktuel og kontinuerlig udvidelse af vores molekylær diagnostiske opgaver.
Dine arbejdsopgaver:

• Ansvarlig for udvikling og implementering af vådlabsdelen af PacBio i fællesskab med afdelingens bioanalytikere.
• Ansvarlig for udvikling og implementering af bioinformatiske pipelines til fortolkning af PacBio-data i fællesskab med afdelingens bioinformatikere.
• Aktiv deltagelse i udviklingen af afdelingens analyser og metoder

Vores afdeling er i fortsat vækst, hvilket giver anledning til en høj grad af indflydelse, medansvar og mulighed for at udvikle og præge stillingen. Du kommer til at arbejde på et hospital, hvor der er kort vej fra tanke til virkelighed - takket være en kultur, hvor samarbejde på tværs af faggrupper og specialer er en integreret del af hverdagen. AfMD er blandt andet en del af Nordjyllands Gensekventerings Center (NGSC), der sikrer det faglige fællesskab om avancerede molekylærgenetiske analyser i de diagnostiske specialer. Derudover er der et tæt samarbejde med klinikere fra forskellige specialer, både formelt i regi af multidisciplinære teams (MDT) og uformelt.

Om dig
Vi søger en omhyggelig, motiveret og selvstændig person med humor, tolerance og gode samarbejdsevner, der ønsker et job med rig mulighed for udvikling og medansvar. Fagligt er det et krav at du:

• Har en Ph.D.-grad inden for PacBio-sekventering eller anden betydelig forskningserfaring indenfor dette område.
• Er uddannet Cand. Scient. eller Cand. Polyt., med relevant molekylærbiologisk/bioteknologisk specialisering
• Har hands-on erfaring med biblioteksfremstilling til PacBio Revio sekventering
• Har erfaring med bioinformatisk analyse af PacBio-data
• Mestrer mundtlig og skriftlig kommunikation på engelsk og dansk
• Trives og arbejder effektivt i fællesskaber

Endvidere vil følgende være en fordel, men ikke et krav:

• Erfaring med at arbejde i et klinisk/paraklinisk miljø.
• Erfaring med at arbejde med omics-data af forskellige typer.
• Erfaring med ONT-sekventering.
• Erfaring med virus diagnostik.
• Erfaring med brug af Laboratory Information Management System (LIMS).

Vi tilbyder
AfMD tilbyder et ambitiøst, lærende og anerkendende fagligt miljø. Vi har mange års erfaring med molekylær diagnostik af patienter i Region Nordjylland.
Er du interesseret i det tekniske, kan vi nævne, at vi har fire NGS sekventeringsplatforme fra Illumina, PacBio og Oxford Nanopore. Flere forskellige real-time PCR-platforme og ddPCR. I bioinformatikken bruger vi både open-source og proprietær software, udvikler pipelines og programmer. Alt sammen for at kunne foretage dataanalysen af de store mængder data fra vores sekventeringsanalyser. Vi arbejder desuden med flere forskellige programmeringssprog i vores Linux servermiljø.

Om os
Vi leverer diagnostiske resultater og forskning inden for cancersygdomme, sjældne genetiske sygdomme, noninvasive graviditetstest (NIPT), præimplantations genetisk test (PGT) og Personlig Medicin. Vi har særlige forskningsinteresser indenfor epigenetik i relation til bl.a. cancer og lever fibrose.
Forskning er en essentiel del af afdelingens virke. I 2023 udgav afdelingen 23 videnskabelige artikler. AfMD indgår i større tværfaglige forskningsprojekter, eksempelvis forskningsKUBEN REPAIR, samt et nationalt studie til undersøgelse af effekten af aneuploidiscreening i forbindelse med PGT for monogene sygdomme, finansieret af Danmarks Frie Forskningsfond.
I Afdeling for Molekylær Diagnostik er vi 14 bioanalytikere og 19 akademikere - heraf 4 bioinformatikere, 2 kliniske laboratoriegenetikere og 1 læge. Vi har 4 ph.d-studerende og en post-doc. Afdelingen har desuden tilknyttet speciallæger og akademikere fra andre afdelinger.

Vil du vide mere?
For yderlig information om stillingen venligst kontakt:
Inge Søkilde Pedersen, cheflaboratoriegenetiker, professor
E-mail: isp@rn.dk

Det praktiske
Løn- og ansættelsesvilkår efter gældende overenskomst.

Arbejdsstedet er Aalborg Universitetshospital, Nord, Reberbansgade 15, 9000 Aalborg.
I løbet af 2025 forventer vi at flytte til Hospitalsbyen i Aalborg øst.

Arbejdstid er på 37 timer om ugen.

Ansøgning mrk. ”Klinisk Akademiker - PacBio” - vedhæftet eksamenspapirer, CV og publikationsliste.

Ansøgningsfrist: 29.12.2024
Vi forventer at holde ansættelsessamtaler i uge 2, 2025.

Om Region Nordjylland
Vi er ca. 15.000 meget forskellige medarbejdere, der hver dag leverer velfærd til omkring 590.000 nordjyder inden for sundhed, regional udvikling og det specialiserede socialområde. Vi opfordrer alle kvalificerede til at søge jobbet - uanset etnisk baggrund, køn, seksuel orientering, handicap, religion eller alder. Læs mere om os på www.rn.dk.